Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ3O43525 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ3O43525 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms