Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA3O43365 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA3O43365 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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