Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIAH2O43255 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIAH2O43255 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms