Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNMO15061 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNMO15061 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNMO15061 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNMO15061 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNMO15061 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNMO15061 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNMO15061 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNMO15061 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNMO15061 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms