Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFIT3O14879 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIT3O14879 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms