Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCER2I3L3R5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCER2I3L3R5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms