Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L11C9JVI0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L11C9JVI0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L11C9JVI0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L11C9JVI0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms