Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9JCJ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C9JCJ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9JCJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9JCJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9JCJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9JCJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms