Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4DXG7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4DXG7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B4DXG7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms