Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF879B4DU55 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms