Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM88BA6NKF7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms