Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC69A6NI79 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC69A6NI79 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms