Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF316A6NFI3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms