Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSDA5PKW4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSDA5PKW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms