Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC144AA2RUR9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC144AA2RUR9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms