Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf170A2RU37 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf170A2RU37 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms