Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
COL4A6Q14031 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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