Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEST3-210ENST00000551160 721 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049833.2-201ENST00000557211 750 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020892.2-201ENST00000557891 387 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005202.3-201ENST00000582033 567 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNG1-203ENST00000447445 1391 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1K-204ENST00000508256 923 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083841.1-201ENST00000523657 670 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01965-202ENST00000537492 552 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137002.1-201ENST00000600642 182 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6742-201ENST00000622338 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B2-201ENST00000199936 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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