Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC027313.1-201ENST00000509159 1666 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AF127577.3-201ENST00000430391 781 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 LINC01053-201ENST00000457628 771 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC244090.2-201ENST00000567614 792 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 AL355312.2-201ENST00000455607 1541 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 TRIM51FP-201ENST00000526452 1353 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PACSIN3Q9UKS6 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms