Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC090358.1-201ENST00000579862 852 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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ATG4DQ86TL0 TDRD12-201ENST00000421545 1317 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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ATG4DQ86TL0 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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ATG4DQ86TL0 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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