Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OSGEPL1-204ENST00000519810 2216 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PDK4Q16654 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms