Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
LMO3Q8TAP4 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
LMO3Q8TAP4 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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