Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GRAMD2B-212ENST00000513040 2196 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KLRC1-207ENST00000544822 1600 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms