Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC012157.1-201ENST00000549725 501 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC138331.1-201ENST00000549993 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CSAG4-202ENST00000583763 237 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SLC25A6P5-202ENST00000602729 1038 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 MEST-203ENST00000378576 2180 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL035420.1-201ENST00000430679 458 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
IFFO1Q0D2I5 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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