Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC143336.1-201ENST00000614164 836 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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HDAC11Q96DB2 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HDAC11Q96DB2 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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