Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CYP2C18-202ENST00000339022 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC091132.4-201ENST00000587960 2262 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC093655.1-201ENST00000446187 641 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RBMY2OP-201ENST00000447105 810 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC105393.1-202ENST00000449621 598 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP35-201ENST00000513369 976 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC103770.1-201ENST00000517884 833 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC234791.1-201ENST00000620830 1203 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRIM49D2-201ENST00000526396 1411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DYNLRB1-201ENST00000300469 1464 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR4N4-201ENST00000328795 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SSX2-202ENST00000337502 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GCG-201ENST00000375497 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 U3.17-201ENST00000390863 203 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL357084.1-201ENST00000407538 454 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GHRHR-204ENST00000409316 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms