Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPHKAPQ2M3C7 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPHKAPQ2M3C7 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPHKAPQ2M3C7 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPHKAPQ2M3C7 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPHKAPQ2M3C7 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF711-203ENST00000373165 4124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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