Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC013643.2-201ENST00000521510 584 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDK4Q16654 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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