Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP63-201ENST00000405405 1007 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN2R10P-201ENST00000411871 853 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01053-201ENST00000457628 771 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL698P-201ENST00000480095 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010531.3-201ENST00000569147 513 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM95B1-210ENST00000591605 743 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007785.1-201ENST00000597989 332 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139220.2-211ENST00000628234 754 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVIVOR22-2-201ENST00000430579 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024082.1-201ENST00000435250 699 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCE1-AS2-204ENST00000438899 945 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002480.3-201ENST00000439823 557 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL754P-201ENST00000470784 266 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009108.1-201ENST00000473913 796 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001318.1-201ENST00000476981 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106795.1-207ENST00000507037 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACA64.6-201ENST00000516310 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00837-203ENST00000608061 555 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL4L2-211ENST00000613173 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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