Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FABP7-201ENST00000356535 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR7D1P-201ENST00000592739 933 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IL5RA-203ENST00000383846 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CHRDL1-203ENST00000394797 2413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
POLR2AP24928 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms