Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9Y3F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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