Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOP58Q9Y2X3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms