Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC4Q9Y296 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms