Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHOC2Q9UQ13 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms