Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
THSD7AQ9UPZ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD7AQ9UPZ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD7AQ9UPZ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms