Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN3Q9UPQ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms