Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INO80Q9ULG1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms