Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF608Q9ULD9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF608Q9ULD9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms