Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PACSIN3Q9UKS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms