Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MLH3Q9UHC1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MLH3Q9UHC1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms