Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms