Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCF2Q9UG63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms