Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IFT172Q9UG01 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFT172Q9UG01 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFT172Q9UG01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms