Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL42Q9P2K6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL42Q9P2K6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms