Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CC2D2AQ9P2K1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms