Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms