Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX43Q9NXZ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms