Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM28Q9NW13 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms