Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINM1Q9NU53 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms