Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF4ENIF1Q9NRA8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4ENIF1Q9NRA8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms